Mit der Einführung des BizTalk Servers im Jahr 2000 setzte Microsoft einen Meilenstein in der Integration von Anwendungen und bewies, dass Integration und Prozessautomation nicht unerschwinglich teuer und kompliziert in der Anwendung sein muss.
Bis heute nutzen mehr als 7.000 Unternehemen und Organisationen den BizTalk Server, um ihre Systeme zu integrieren und die Prozesse entlang der Versorgungskette zu automatisieren. Mit der Einführung der Version 5, BizTalk Server 2006 R2, baut das Tool auf dem Geschäftsprozessmanagement sowie der SOA-/ESB-Fähigkeit früherer Versionen auf. Organisationen sollen dabei unterstützt werden, ihre Kerngeschäftsprozesse um neue Funktionalitäten zu erweitern. Dazu gehört die Unterstützung von Electronic Data Interchange (EDI), AS2 und RFID sowie die Ausrichtung auf neue Versionen von Microsoft Office, Windows Vista, inklusive .NET Framework Technologie, Windows Workflow und Windows Communication Foundation.